医療費控除をスマホで申告｜マイナポータル連携で楽にする方法

毎年春の確定申告シーズン、医療費控除の申告って本当に手間がかかりますよね。領収書を集めて、計算して、税務署に提出して…。でも、いまはスマホとマイナポータルを使えば、自宅のソファに座ったまま申告できちゃうんです。今回は、医療費控除をデジタルで簡単に済ませるコツをご紹介します。

医療費控除の基本をおさえよう

まず、医療費控除がどのくらい戻ってくるのかをざっくり理解しておきましょう。

医療費控除の計算式

控除額 = （年間医療費 − 保険金等で補填された金額 − 10万円）

ただし、所得金額の5%がこの10万円より低い場合はそちらを引きます。上限は200万円です。

控除額がいくらになるか見てみよう

年収400万円の会社員が、年間医療費25万円を使った場合を例にしてみます。

「あ、戻ってくるんだ！」と感じたら、申告する価値ありです。

対象になる医療費・ならない医療費

対象になる医療費

• 病院・クリニックの診察・検査・治療費
• 薬局で処方された医薬品（処方箋）
• 入院・手術費用
• 歯科治療（保険診療の範囲内）
• 通院のための交通費（バスや電車、タクシー）
• 妊娠・出産関連の費用

対象にならない医療費

• 医療用医薬品以外のサプリメント・ビタミン剤
• 健康診断・人間ドック（異常がない場合）
• 予防接種（任意）
• 美容目的の矯正・施術
• 医療用ウィッグ（控除対象外）

スマホ申告が便利な3つの理由

わざわざ税務署に行ったり、パソコンを立ち上げたりしなくても大丈夫。スマホ申告がいま急速に広がっているのには、ちゃんと理由があります。

理由1：どこでもいつでも申告できる

朝のコーヒーを飲みながら、通勤電車の中で、夜寝る前に…申告の時間や場所に制限がありません。確定申告期限の 2月16日〜3月15日（2026年5月時点）に間に合うように、好きなペースで進められます。

理由2：マイナンバーカードがあれば認証が簡単

マイナンバーカードをスマートフォンに読み込ませれば、本人確認が一瞬で完了。面倒な書類添付や税務署への郵送も不要です。

理由3：計算間違いがほぼゼロ

手書きの申告書は計算ミスのリスクがありますが、e-Taxなら自動計算。医療費の合計から控除額まで、すべてシステムが正確に処理してくれます。

マイナポータル連携で医療費情報を自動取得

いちばんの手間は「どの医療費をいくら使ったか」を整理することですよね。ここでマイナポータルが大活躍します。

マイナポータルの医療費通知機能とは

健康保険から発行される「医療費通知」がマイナポータルに自動表示される仕組みです。2026年5月時点では、多くの健康保険組合や全国健康保険協会（協会けんぽ）がこの連携に対応しています。

自動取得できる情報

• 受診年月日
• 診療機関の名称
• 医療費（患者自己負担分）
• 診療科目

この情報がそのままe-Taxの申告画面に反映されるので、わざわざ領収書を見ながら手入力する必要がありません。

注意：医療費通知に含まれないケース

ただし、以下のような医療費はマイナポータルに反映されない可能性があります。

• 市販医薬品（ドラッグストア購入）：保険請求されないため、自分で記録する必要があります
• 自費診療（健康保険が使えない治療）：記載されません
• 他の都道府県の医療機関：タイミングによって遅延することも
• 歯科自由診療：含まれません

これらは別途、領収書を保存しておいて、申告時に手入力します。

スマホで医療費控除を申告する手順

では、実際の申告方法をステップバイステップで解説します。

準備するもの

ステップ1：マイナポータルで医療費情報を確認

まず、マイナポータルアプリを開いて、自分の医療費通知が届いているか確認します。

1. マイナポータルアプリを起動
2. マイナンバーカードで本人認証（NFC読み込み）
3. 「医療費通知」メニューを選択
4. 対象年度の医療費情報を表示

ここで「あ、この医療費、記録されてるんだ」と確認できます。同時に「あ、この市販薬は入ってないな」という漏れも発見できます。

ステップ2：医療費の手入力分を整理

マイナポータルに反映されなかった医療費について、以下の情報をメモ帳やExcelで整理しておくと、後が楽です。

記録する項目

• 診療年月日（または購入日）
• 医療機関名または薬局名
• 支払金額
• 診療科目（診療費の場合）

ステップ3：e-Taxアプリで申告書を作成

1. e-Taxアプリを開き、「申告書作成」を選択
2. 申告区分を「確定申告」に設定
3. マイナンバーカードで本人認証
4. 「医療費控除」を選択

ここでマイナポータルの医療費情報が自動読み込みされるので、あとは手入力分を追加するだけです。

ステップ4：控除額を確認して送信

アプリが自動計算した控除額（15万円だったり、20万円だったり）を確認して、そのまま送信。税務署への提出は不要で、データがe-Taxサーバーに到達した時点で完了です。

よくある質問・つまずきポイント

実際に申告してみるとき、多くの人が迷う点をまとめました。

Q1：マイナンバーカードの電子証明書の有効期限が切れていました

マイナンバーカードの電子証明書は、カード発行から5年で有効期限を迎えます。期限切れの場合は、お住まいの市区町村役場で更新手続きが必要です。更新自体は無料で、その場で完了します。オンライン申告をするなら、この機会に更新しておくことをおすすめします。

Q2：マイナポータルに医療費通知が何も表示されません

健康保険組合の発行スケジュールの都合で、遅れて表示されることがあります。翌月以降に確認してみてください。また、職場の健康保険がまだマイナポータル連携に対応していない場合もあります。その場合は領収書から手入力になります。

Q3：去年の医療費も追加で申告できますか

医療費控除は、医療費が使われた年度の申告に含めます。昨年分を申告し忘れた場合は、遡って申告できます。ただし原則として、医療費が使われた年の翌年から5年以内なら申告可能です（2026年5月時点）。古い分は手入力になります。

Q4：市販医薬品をたくさん買ったとき、どう記録する？

買ったときのレシート（領収書）を取っておき、品目、金額を記録します。家族の分も合算できるので、「家族全員の医療費をひとりの人が申告する」ことも可能です。ただしセルフメディケーション税制との併用はできない点に注意（どちらか有利な方を選ぶ）。

スマホ申告に対応するための環境づくり

最後に、スムーズに申告するための環境整備をお伝えします。

Wi-Fi環境は必須

e-Taxの送信時には安定したインターネット接続が必要です。可能なら自宅のWi-Fi環境で申告してください。モバイル回線だと途中で切れることもあります。

事前に領収書をデジタル化

医療費の領収書をスマートフォンのカメラで撮影して、整理フォルダに保存しておくと、後で見返すときに便利です。国税庁も「領収書の保存は電子化してもOK」と認めているので、紙で保存する負担を減らせます。

夜間や土日の申告も可能

e-Taxは24時間、年中無休で受け付けています。3月15日が近づいて混雑する前に、余裕をもって申告するのがコツです。

まとめ

医療費控除のスマホ申告は、もはや「便利なオプション」ではなく「スタンダード」になりつつあります。マイナポータルの医療費通知連携なら、面倒な領収書の整理や計算もぐんと楽になります。

今年のポイント

• 控除額 = （年間医療費 − 10万円）で戻ってくる税金を計算してみる
• マイナポータルで医療費情報を自動取得する
• 市販医薬品など漏れた分だけ手入力する
• e-Taxアプリで確認→送信、わずか5分で完了

10万円以上の医療費を使った年は、申告してこそ税金が戻ってきます。今年は、スマホで気軽に申告してみてはいかがでしょうか。